Plant Molecular and Cellular Biology

■ Protein expression using Nicotiana benthamiana plants.
■ Production of pharmaceutical proteins using Tsukuba system.
■ Functionl charactrization of recombinant proteins using mammalian cell culture lines.

■生物圏資源科学

■生物圏変遷科学

■コノドント古生物学、古生代地史

■生態学

生命産業科学

■細胞機能開発工学
■バイオ産業科学

■新規機能を付加した細胞およびプロトプラストの培養法の開発と利用
■複合生物系の解析と人工の複合生物系培養システムの開発と利用
■発展途上国におけるバイオプロセスの開発
■微生物、植物、動物の細胞等を対象とした、新規培養法開発、機能解析、培養工学、生物化学工学

■水利環境工学

■農業水利システムの開発と管理
■管路内非定常流れを応用した異常検知
■流れの可視化、解析

■動物資源生産学

■家畜・家禽の環境適応生理と生産機能に関する研究
■家畜・家禽の育種・繁殖学的研究
■動物遺伝資源の特性評価と高度利用に関する研究

■土壌環境化学

■森林土壌の環境化学的研究
■土壌有機物の土壌生態学的研究
■ユーラシアステップの土壌保全

■水文科学
■水循環持続論

■水文気象
■大気－陸面－植生相互作用
■大気境界層乱流
■水文気象学、大気－陸面－植生相互作用、大気境界層乱流
■様々な場の条件における地表水、地下水循環と人間活動
■水域における水循環と生態系の関係
■放射性物質の水系環境中における動態

■エピジェネティクス

■シロイヌナズナのストレス反応におけるDRE2の役割
■中央細胞配偶子の母性遺伝子発現における鉄の代謝とFe-Sクラスター生成複合体の役割の特定
■多年性アブラナ科植物における花芽形成の生理学的研究
■FLCクロマチンにおけるプロモーター領域とポリコーム応答シス因子の決定
■シロイヌナズナにおけるポリコーム応答因子の機能解明
■VIN3遺伝子における二つのタイプのエピゲノムメモリーの機構解明

■外科学一般
■分子生物学
■細胞生物学
■発生生物学
■実験動物学
■神経生理学・神経科学一般

■動物発生・生理学

■イモリ体組織の外傷性応答と再生の分子機構
■哺乳類体組織の外傷性応答と疾患の分子機構
■脱分化・分化転換の誘導と制御の分子機構

■分子細胞生物学

■選択的タンパク質分解機構の分子遺伝学的機能解析
■ユビキチンによるタンパク質修飾の分子細胞生物学的研究
■ユビキチン代謝異常マウスの生体高次機能解析

先端分子生物科学

■微生物の有する新規代謝経路・酵素の探索
■アミノ酸生合成経路の多様性解析を通じた代謝進化の解明
■生化学と触媒化学の融合による酵素最適化因子の特定

■応用分子細胞生物学

■系統分類・進化学
■菌類学・植物系統分類学

■菌類の自然史、多様性
■接合菌類・ツボカビ類の系統分類学的研究
■生物間相互作用・生活環に着目した菌類の生態的特性の解明

■応用生命化学領域
■機能性神経素子工学

■モデル生物を用いた脳神経形成と機能維持を制御する因子の解析
■老化に伴う脳神経系の破綻や疾患を防ぐ物質や因子の探索と疾患モデル動物の開発
■神経機能の生体内イメージング技術の開発

■応用微生物学

■生物材料工学
■環境材料科学

■紙の機能を活用したペーパーエレクトロニクスと紙センサー開発
■記録遺産としての書籍及び紙文化財の保存修復技術
■化学修飾木材を用いた高性能楽器用材の開発
■ナノスフェアを出発原料とした複合材料の調製
■含フッ素縮合系高分子を用いた複合材料の調製
■ポリアミノ酸や多糖類の化学修飾
■楽器用に用いられる生物材料の音響特性と物性制御
■木材のセル構造・FRP構造を活かした高度利用技術の開発
■天然接着剤（漆、キトサン等）の物性解明と利用技術の開発

■蔬菜・花卉学

■蔬菜・花卉の重要形質に関連した遺伝子機能の解明
■蔬菜・花卉の新規形質転換技術開発と形質転換体を活用した高品質化の研究
■蔬菜・花卉の高付加価値化・高収量化に関する研究

持続環境科学

■地圏変遷科学

■地層に記録された地震・津波

惑星資源科学

■地球生命史
■テクトニクス

動物系統分類学 / 系統分類・進化学

■昆虫類の比較形態学的研究および系統分類学的研究
■ゴキブリ類の比較発生学的研究
■ゴキブリ類の脂肪体内共生細菌の進入機構に関する発生学的検討

■農林生物学領域
■植物環境応答学

■高等植物におけるストレス耐性の分子遺伝学的解明
■不良環境耐性作物の開発

■先端分子生物科学

■高等植物の遺伝子発現制御メカニズムに関する研究
■転写因子制御・遺伝子改変による有用植物の研究開発
■高等植物における転写因子の機能解析

■ゲノム情報生物学

■転写(制御)因子の修飾調節の解明
■栄養と代謝による寿命・老化の分子メカニズム
■脳の代謝機能の解明
■ゲノミック・インプリンティング
■恒常性維持のための遺伝子発現制御
■生体分子のメチル化と修飾酵素の同定
■転写と代謝が調節する寿命･老化
■哺乳動物のゲノム刷り込みや血圧恒常性維持などのエピジェネティクス・遺伝子発現制御

■応用生命化学領域
■共生進化生物学

■昆虫類と微生物の内部共生関係の機能、進化、起源の解明
■共生、寄生、生殖操作、形態操作などの高度な生物間相互作用に関わる分子、生理、調節機構の解明
■昆虫類における社会性の形成や維持に関与する分子基盤の解明

■生産・管理システム

■超省力農作業システム、低コスト・環境負荷低減型作物生産システム
■ナノテクノロジー、バイオテクノロジー、ＩＴ等を活用した計測制御手法の確立

■蔬菜・花卉学

■蔬菜・花卉の重要形質に関連した遺伝子機能の解明
■蔬菜・花卉の新規形質転換技術開発と形質転換体を活用した高品質化の研究
■蔬菜・花卉の高付加価値化・高収量化に関する研究

■生体成分化学
■環境植物生理

■植物における金属輸送とその制御機構の解明
■金属イオンによる障害および耐性機構の解明
■環境とホルモンによる根の機能制御と導管液有機物質の働きの解明
■植物の発生過程および環境応答において細胞壁架橋が果たす役割の解明
■放射線を用いた可視化技術の開発と応用

■応用動物昆虫学

■昆虫制御剤の作用機構に関する研究
■害虫の化学・生物的防除法に関する研究
■昆虫の行動・生理制御機構に関する化学・行動生態的研究

■分析科学
■ポストハーベスト工学
■食品科学

■各種分光手法の食品分析への応用
■分光計測による食品加工プロセスの分析手法の開発
■分光ビッグデータの効率的な解析法の開発

■糸状菌相互応答学

■微生物二次代謝を活性化させる生物間相互作用の探索
■糸状菌の相互作用・相互応答現象における分子メカニズムの解明
■複合環境における微生物（糸状菌）の生理・生態の解明

■ゲノム情報学

■生物物理学・理論生物学
■分子動力学シミュレーションによる生体機能の解析
■合理的in silico創薬を実現する分子シミュレーション手法開発

■生態学

■微生物育種工学

■新規な代謝の探索および生理学的機能解析
■代謝工学及び有用酵素･遺伝子の探索･解析･設計・改造
■C-N結合切断および合成酵素の分子機能解析と分子進化に関する研究
■微生物・酵素のスーパー生体触媒への新機能開発
■糖および核酸関連酸素の構造機能解析およびＤＮＡ・ＲＮＡ工学への応用

■地形学

■水文地形学
■斜面崩壊
■岩石風化
■カルスト地形

■動物発生・生理学

■動物発生・生理学

■生物反応工学

■ベシクルやエマルション、分子集合体を利用した食品・薬理機能成分送達システムの開発
■酵素および微生物による有用物質生産

■分子細胞生物学

■二次共生による葉緑体進化に関する研究
■微細藻類の葉緑体の制御機構に関する研究
■微細藻類のゲノム進化に関する研究

■先端細胞生物科学

■電子顕微鏡とコンピュータ画像解析による生体分子の構造研究
■分子モータータンパク質の運動機構の解明

■生態学
■生態系生態学

■植物の環境応答に対する生態学的研究
■陸域生態系における炭素循環に関する研究
■陸域生態系における炭素循環および地球温暖化ガス動態
■高山生態系における地球環境変化の影響評価
■水圏生態系における物質の代謝と動態
■地球環境変化の生物圏の影響評価
■植物の分布と環境への適応戦略
■陸域生態系における炭素動態
■海洋微生物を通した炭素循環、海洋環境における有機物の動態

■系統分類・進化学

■形態データに基づく爬虫類の分類学
■爬虫類と鳥類の分子系統学および生物地理学
■爬虫類と両生類の保全遺伝学

■菌類学

■菌類（担子菌門ハラタケ綱）の分類・系統進化・生物地理学
■環境中（土壌、水、空気など）における菌類の多様性
■菌類の標本・分子・メタデータに基づく博物学

■生物反応工学

■ベシクルやエマルション、分子集合体を利用した食品・薬理機能成分送達システムの開発
■酵素および微生物による有用物質生産

地球環境科学

水災害科学

■大気海洋相互作用現象
■気象災害
■極端現象

■地形学

■寒冷地形学
■永久凍土モニタリング
■山岳環境

■岩石学

■火成岩岩石学
■鉱床学
■火山学
■地球化学

■分子細胞生物学

■鞭毛・繊毛の構造、運動機構、運動調節
■繊毛の多様化と真核生物進化
■海産生物（原生生物、無脊椎動物および魚類）の受精・生殖機構

■ゲノム情報学

■真核生物の分子系統解析
■生物種間での遺伝子水平運動
■立体構造と分子進化情報を組合わせたタンパク質の機能解析

■応用生命化学領域
■動物リソース工学

■核移植クローン技術を用いた生殖細胞ゲノムの特性解析
■核移植クローン技術を用いた胚性遺伝子活性化機序の解析
■顕微授精技術を用いた雄性生殖細胞保存技術の開発

■環境植物生理

■環境とホルモンによる根の機能制御と導管液有機物質の働きの解明、植物の傷害回復と組織癒合の機構解明
■植物の発生過程および環境応答において細胞壁架橋が果たす役割の解明
■植物における金属輸送とその制御機構の解明、金属イオンによる障害および耐性機構の解明
■Carbon / nitrogen interactions between legumes and parasitic plants

■応用生物化学
■実験動物学

■系統分類・進化学
■植物系統分類学

■細胞構造と分子系統解析に基づく藻類および原生生物の系統分類
■一次および二次共生による葉緑体の誕生と進化
■藻類バイオマス研究のための有用藻類の探索

■水利環境工学

■農業水利の開発と管理
■水資源の利用と評価
■農民参加型灌漑管理

■海洋・大気相互システム

■海洋学
■大気海洋相互作用
■気候変動

■分子細胞生物学

■ミトコンドリアＤＮＡの突然変異が細胞や生体の機能に及ぼす影響の解析
■核遺伝子とミトコンドリア機能の相互作用に関する研究
■モデル動物を用いたミトコンドリア関連疾患の病態発症機構解明

■食薬資源環境学

■バイオアッセイ手法による水のリスク評価
■生体内代謝環境を調節する生物活性物質の作用機構解析
■食資源の機能解析と有効利用に関する国際研究
■バイオマスからの機能性成分探索
■ケミカルバイオロジー的手法を用いた細胞内タンパク質の機能制御

■ゲノム情報学

■バイオシステム学
■バイオ産業科学

■再生医療基盤技術（幹細胞等の品質管理、大量培養、分化誘導）
■発生生物学（モデル生物を用いた各種臓器形成・再生メカニズム解明）

■環境植物生理
■植物発生生理学

■環境とホルモンによる根の機能制御と導管液有機物質の働きの解明、植物の傷害回復と組織癒合の機構解明
■植物の発生過程および環境応答において細胞壁架橋が果たす役割の解明
■植物の細胞壁架橋形成メカニズムに関する研究
■植物における金属輸送とその制御機構の解明、金属イオンによる障害および耐性機構の解明
■Carbon / nitrogen interactions between legumes and parasitic plants

■動物生態学

■海洋・大気相互システム

■大気化学
■エアロゾル・雲・放射相互作用

■生物材料工学

■紙の機能を活用したペーパーエレクトロニクスと紙センサー開発
■記録遺産としての書籍及び紙文化財の保存修復技術
■化学修飾木材を用いた高性能楽器用材の開発
■ナノスフェアを出発原料とした複合材料の調製
■含フッ素縮合系高分子を用いた複合材料の調製
■ポリアミノ酸や多糖類の化学修飾
■楽器用に用いられる生物材料の音響特性と物性制御
■木材のセル構造・FRP構造を活かした高度利用技術の開発
■天然接着剤（漆、キトサン等）の物性解明と利用技術の開発
■材料科学における合成化学、複雑系高分子の調整と性質

■神経生理学・神経科学一般
■機能生物化学
■生物分子化学

■大気循環環境論

■大気・海洋・陸面間の水・エネルギーバランス
■全球スケールでの熱・水循環変動機構
■多様なスケールでの大気環境と人間活動との関係
■二酸化炭素濃度の上昇に対する対流圏調整過程

■地圏変遷科学

■東南アジアの構造発達史

■森林生態環境学

■森林生態系の維持機構と機能に関する研究
■植生とその管理に関する研究
■半乾燥地の植生と復元に関する研究
■希少生物の保全に関する研究
■火山島における森林生態系の維持・成立メカニズム

■動物生命科学

■分子発生制御学

■配偶子形成過程での遺伝子転写・翻訳制御の解析
■受精・卵子活性化、および初期胚発生に関与する制御因子の同定と機能解析
■次世代生殖・発生技術の開発

■水循環資源
■環境動態解析学

■水環境の実態解明及びモデリング
■山地からの土砂生産、地形形成、及び土砂収支の解明
■福島原発事故起源の放射性物質の環境中での移行
■地球化学的手法による環境変動の解析
■地球における元素循環プロセスの解明
■森林水文学、土壌侵食、環境放射能

■生物圏資源科学

■森林生態環境学
■植物生態学

■森林生態系の維持機構と機能に関する研究
■植生とその管理に関する研究
■半乾燥地の植生と復元に関する研究
■希少生物の保全に関する研究

生物圏資源科学

■植物発生・生理学
■遺伝資源産業科学

■高等植物における環境ストレス応答の多様性に関する研究
■高等植物における分化全能性の発現機構に関する研究
■ストレス生理学、分子育種、不定胚形成

■生体情報制御学

■細胞分裂期における染色体動態の解析
■染色体凝縮タンパク質コンデンシンの機能解析
■核小体の新規機能の解析

■応用生命化学領域
■複合生物系利用工学

■未知の有用微生物の探索技術の開発および希少微生物の分離培養と分類同定
■微生物や高等生物を対象にした有用遺伝子資源の探索と機能解明および産業利用
■環境ゲノム解析技術（メタゲノム、メタトランスクリプトーム等）の開発
■環境制御・浄化や次世代エネルギー生産に資する微生物の生理学的・生態学的機能の解明と利用

■生物圏資源科学

■農産食品プロセス工学
■資源開発技術学
■食料システム学

■Wet millingによる食品危害要因の除去
■Spray dryによる健康機能成分の粉末化
■Rice slurryを活用した新規の食品開発
■食品プロセス工学、ポストハーベストテクノロジー、機能性食品加工と産業化、バイオマス変換と総合利用

■微生物育種工学

■新規な代謝の探索および生理学的機能解析
■代謝工学及び有用酵素･遺伝子の探索･解析･設計・改造
■C-N結合切断および合成酵素の分子機能解析と分子進化に関する研究
■微生物・酵素のスーパー生体触媒への新機能開発
■糖および核酸関連酸素の構造機能解析およびＤＮＡ・ＲＮＡ工学への応用

■環境コロイド界面工学
■生産基盤システム工学

■土壌の水分と溶質移動、塩類集積、土壌侵食
■乾燥地域の水資源の有効利用に関する工学的研究、貯水池濁水対策
■土壌の物理化学的性質、土壌汚染、コロイド界面現象の基礎
■農地工学、土壌保全、農地をとりまく物質循環
■土壌物理学、環境材料

■動物発生・生理学

■動物における生殖細胞形成の共通原理の解明
■ショウジョウバエの生殖細胞の性決定に関わる遺伝子経路の解明
■ショウジョウバエにおける生殖幹細胞の維持機構解明

■応用生命化学領域
■食品分子認識工学

■特異的な分子認識能を持つ生体分子の探索及びその効率化に関する研究
■終末糖化産物の構造と機能に関する研究

■食料システム学

■地球史解析科学

■哺乳類古生物学

■森林資源社会学

■森林資源の地域社会管理に関する研究
■森林経営の形成・展開と地域社会に関する研究
■森林共同組織に関する研究

■生物環境工学領域
■国際生物資源循環学

■生物機能を用いたバイオマスの利活用技術の研究

■人文地理学

■応用微生物学

■果樹ゲノム育種

■落葉果樹類のＤＮＡマーカー、分子遺伝、ゲノム育種に関する研究
■気候変動への対応に向けた果樹の環境応答性の解明
■リンゴ等果樹における大量ゲノムデータの育種への利用に関する研究

■応用動物昆虫学

■捕食寄生性昆虫の行動生態学、化学生態学、進化生態学的研究
■植物ー昆虫間相互作用および植物ー菌ー昆虫間相互作用に関する研究
■生物的防除や多様性保全のための昆虫類の行動制御に関する研究
■昆虫類の生活史戦略に関する研究

■地誌学
■観光地理学

■日本とヨーロッパの地誌、観光地域研究

■鉱物学

■鉱物の微量元素分析、流体包有物、考古学試料分析
■流体包有物中の微量元素の分析と地殻内部での流体による元素運搬の解明

■空間情報科学

■都市気候・山岳気象・応用気象（風力発電予測、生気象等）
■局地気象
■天気予報
■数値シミュレーション

■代謝ネットワーク科学

■実用作物における重要農業形質の遺伝解析
■代謝物の量的・質的変化を捉えるための測定法の開発
■オミックスデータを用いた代謝ネットワーク解析

■ゲノム情報学

■ソリトン波様細胞集団運動の解析
■細胞内情報伝達機構におけるヒト病原遺伝子の機能解明
■細胞レベルでの記憶と時空間認識の分子メカニズムの解明
■細胞性粘菌由来ガン抑制遺伝子の解析とカフェインによる抗ガン剤増強メカニズムの解明

■鉱物学

■鉱物合成、結晶構造解析

生物資源持続循環論

■エコシステム工学手法を用いた廃水浄化技術の開発
■低負荷環境共生型の水質改善手法
■農産廃棄物の再資源化及び機能性食品の開発
■水域における炭素等の物質循環
■持続的水利用のための水環境修復
■微生物代謝産物による浄水処理阻害とその対策
■廃水・廃棄物処理及び資源回収プロセスと技術の開発

■生物圏資源科学

■応用微生物学
■分子生物学
■ゲノム科学
■生物工学

■微細藻類のゲノム解析
■微細藻類を用いた有用物質生産
■微細藻類を用いた環境浄化

国際地縁技術開発科学

■食資源工学

■マイクロ・ナノ工学による生物資源の先進加工技術の開発と応用
■マイクロ・ナノチャネルを利用した先進食品加工システムの構築
■食品マイクロ・ナノ分散系の作製と体内動態の評価
■未利用食品素材と食品加工廃棄物の再資源化による高度利用技術の開発

■動物発生・生理学

■惑星資源科学
■水循環資源

■同位体地質学、地球化学
■水環境の実態解明及びモデリング
■山地からの土砂生産、地形形成、及び土砂収支の解明
■福島原発事故起源の放射性物質の環境中での移行
■地球化学的手法による環境変動の解析
■地球における元素循環プロセスの解明

遺伝資源産業科学

■比較ゲノム
■植物環境応答
■転写ネットワーク

■先端分子生物科学

■木本植物の個体群生態学
■森林生態系の構造と動態解析
■森林の育成と管理の科学的研究

■革新的家畜生産システム

■家畜生産における植物-微生物-動物各界の役割と相互作用の探究

■生態学

■ツンドラ生態系における環境変化の影響評価
■植物および菌類群集の多様性評価
■植物と菌類の生物間相互作用
■陸域生態系における炭素動態

■応用微生物学

■分子細胞生物学

■サイクリン依存性キナーゼの活性化機構と生理機能解明
■分裂酵母における減数分裂の制御機構解明
■ヒト培養細胞における抗生物質の生産

■大気科学

■アンサンブル予報
■異常気象の予測可能性
■気候変動予測

■先端細胞生物科学

■ニューロサイエンス、内分泌（特に神経内分泌、生殖内分泌）
■ドラッグリポジショニングを基盤とした創薬研究
■トランスレーショナルリサーチを活用した創薬研究

■作物ゲノム育種

■作物の有用形質の遺伝解析と新品種の作出
■作物の有用形質のマッピングと選抜マーカーの開発
■作物の有用遺伝子のクローニングと機能の解明
■ゲノム情報を利用した作物育種法、育種戦略の策定

■人文地理学

■文化・宗教地理学、文化観光論、都市・農村の地理学

■環境倫理、人文地理学
■文化・社会・生態共生論

■世界のエコリージョンの特質と森林環境の開発と保全
■発展途上国の農村社会における地域資源管理
■先住民族文化と伝統知
■環境・水倫理、環境史、環境・農業政策、先住民族の権利と法律、伝統知、環境紛争解決論

■農業生物学領域
■植生・気候変動影響学

■気候変動が森林生態系機能や生態系サービスに与える影響の評価や適応策に関する研究
■森林植生の広域分布と気候との対応関係に関する研究
■天然分布北限地帯のブナの生態に関する研究

■蔬菜・花卉学

■蔬菜・花卉の重要形質に関連した遺伝子機能の解明
■蔬菜・花卉の新規形質転換技術開発と形質転換体を活用した高品質化の研究
■蔬菜・花卉の高付加価値化・高収量化に関する研究

■水環境
■空間情報科学

■リモートセンシングとＧＩＳ手法による地球環境変化の監視及びモデリング
■環境変化や物質の動態解析とモデル化
■水環境の保全
■持続的発展が可能な地域社会とその構築方法
■リモートセンシング、地球生態学、モデリング

■生物有機化学

■動物生命科学

■系統分類・進化学

■光合成代謝制御
■植物発生生理学

■微細藻類のバイオマス生産を支える炭素・窒素等の代謝の最適化および代謝間の相互作用に関する研究
■微細藻類の光合成機能の環境適応に関わる環境検知の分子機構の研究
■藻類の再生可能エネルギーに関連した生化学、分子生物学
■微細藻類にユニークな金属代謝の解明とその応用
■単細胞性藻類をモデルとした植物の一次代謝制御、環境応答についての研究
■元素分析技術を利用した光合成生物における金属代謝の研究

■分子細胞生物学

■高等植物の環境ストレス応答に関わる検知、シグナル伝達機構の解析
■植物遺伝子工学を利用した有用タンパク質生産
■ゲノム編集作物の作出とその評価

■食薬資源環境学

■創薬・食品への応用を目指した生物活性物質の機能性評価と作用機構解析
■バイオアッセイ手法による水のリスク評価
■生体内代謝環境を調節する生物活性物質の作用機構解析
■食資源の機能解析と有効利用に関する国際研究
■バイオマスからの機能性成分探索
■ケミカルバイオロジー的手法を用いた細胞内タンパク質の機能制御

■環境社会経済政策論

■環境技術・政策の総合評価、数値シミュレーション、環境経済政策
■生態系における技術的外部性、市場失敗、需要顕示選好、共有財などの評価分析
■環境の総合的評価手法
■生産消費システムにかかわる社会経済および環境への影響分析とその評価
■環境技術・政策の総合評価
■廃棄物・リサイクル政策
■国際資源循環政策
■環境政策、環境経済

■空間情報科学

■農業・農村地理学
■農業・農村の持続性
■地理情報科学

■系統分類・進化学

■先端分子生物科学

■バイオマス利活用に関する研究開発
■生物共生系の基礎研究およびその応用技術の研究
■メタおよびシングルトランスクリプトーム解析

応用微生物学

■微生物が作る膜小胞の機能
■微生物が作るウイルス様粒子の機能
■微生物が普遍的に有する金属酵素の機能

■先端細胞生物科学

■寄生性原生生物の感染成立機構の解明
■寄生性原生生物の持つ特殊なオルガネラの機能に関する研究
■原虫感染症制圧に向けた創薬研究

■地域大気汚染学

■都市大気汚染の発生メカニズム
■大気中の汚染物質の動態とモデリング
■大気化学モデリング、広域大気汚染、地球温暖化

■生命機能化学

■動物細胞に作用する天然化合物を用いたケミカルバイオロジー研究（標的分子同定・作用機構解析）

■ゲノム情報学

■哺乳類ミトコンドリアゲノムの生理機能に関する研究
■ミトコンドリア機能と糖尿病、がん、老化に関する研究
■ミトコンドリア遺伝子疾患の発症機構と治療戦略に関する基礎研究

■生物材料化学
■木質科学

■木材蒸解とパルプ漂白の化学
■生物材料の化学的利用とバイオリファイナリー
■リグニン、タンニン、細胞壁構成糖などの木材成分および関連成分の微量分析

■バイオ産業科学
■負荷適応微生物学
■産業微生物資源学

■有用微生物の探索と利用（プラスチック分解・油脂系バイオマスの微生物変換・メタン資化性菌）
■真菌の環境応答･適応・形態形成メカニズムの解明
■新たな微生物･酵素触媒による有用物質生産
■細菌の新規代謝と集団挙動

■負荷対応微生物学
■環境分子微生物

■真菌の環境応答･適応・形態形成メカニズムの解明
■新たな微生物･酵素触媒による有用物質生産
■細菌の新規代謝と集団挙動
■高度好熱菌の宿主・ベクター系の開発と応用
■希少糖の代謝系の解析と応用
■微生物増殖に関する網羅的解析と予測
■実験進化による新規的大腸菌の創出

■ゲノム情報学
■遺伝資源産業科学

■バクテリオファージの感染機構の分子生物学的解析と医学・工学分野への利用科学
■非翻訳型ＲＮＡによる遺伝子発現制御ネットワーク機構の解析
■細胞内におけるＲＮＡ結合性タンパク質の動態・機能の解析
■タンパク質分泌の分子機構、機能RNA分子の機能解析

■系統分類・進化学

■平板動物、珍渦虫、棘皮動物等の進化、発生、形態、生態学的研究
■新口動物・後生動物の起源と進化
■海産無脊椎動物の多様性と進化

■分子細胞生物学

■細胞骨格と膜動態を制御するシグナル伝達経路の解明
■細胞骨格とその制御機構の分子基盤の多様性と進化的考察
■酵母や原生生物を用いた細胞分裂の分子メカニズムの研究

■系統分類・進化学
■植物系統分類学
■環境藻類

■細胞構造と分子系統解析に基づく原生生物の系統分類
■藻類バイオマス研究のための有用藻類の探索
■微細藻類の系統分類学、細胞学、生理・生態学
■オイル産生微細藻類の探索、大量培養技術開発
■微細藻類の再生可能エネルギーに関連した成分の生物有機化学および生理活性物質に関する研究
■微細藻類のオイル抽出プロセス工学、プロセスのエネルギーバランス評価とLCA解析
■環境微生物の遺伝生態の多様性とその藻類培養への高度利用
■藻類カルチャーコレクションの運用と利用

■流域保全工学
■衛星リモートセンシングによる、陸域生態水文学・災害科学
■総合流域管理論

■土砂の生産と流失機構に関する研究
■生物の生息空間を配慮した渓流整備に関する研究
■リモートセンシングによる環境解析
■水資源・治水・防災に関する総合的管理計画
■衛星リモートセンシングを用いた環境モニタリングとモデリング
■山地流域での水環境、物質循環

■花き新育種資源作出・利用

■花の大きさ・形の制御機構の解明と変異誘発技術の開発
■花きにおける病害抵抗性育種と日持ち性の改良
■色素関連化合物の解析に基づいた花の色彩の制御

■動物発生・生理学

■発生・生殖・老化における昆虫ホルモン生合成システムの研究
■ショウジョウバエを用いた生殖幹細胞増殖の神経・内分泌メカニズムの研究
■昆虫発育制御剤の構造生物学・ケミカルバイオロジー

■作物生産学

■作物の効率的生産技術の比較評価と管理に関する研究
■持続可能な生物生産システムの構築と評価に関する研究
■作物の収量・品質制御のための生理生態的特性に関する研究
■作物の環境適応性に関する研究

■バイオシステム学コース
■遺伝資源産業科学
■生物プロセス工学

■生物工学的手法を用いた持続的農林水産業の確立

■微生物機能利用学
■微生物機能循環論

■微生物間のコミュニケーションとバイオフィルムに関する研究
■微生物機能を利用した環境修復と保全
■微生物間の相互作用
■微生物代謝産物の進化学的解析および環境改善への利用
■植物―微生物相互作用のシステム理解
■微生物制御による機能性材料の創製
■物理学と工学技術による細菌の挙動およびバイオフィルム形成の理解

■蔬菜・花卉学

■蔬菜・花卉の重要形質に関連した遺伝子機能の解明
■蔬菜・花卉の新規形質転換技術開発と形質転換体を活用した高品質化の研究
■蔬菜・花卉の高付加価値化・高収量化に関する研究

構造生命科学
タンパク質科学

■　「緑の革命」に係る植物タンパク質の構造・機能解析
■　植物遺伝子工学を利用した有用タンパク質生産

■生物材料工学
■木質材料工学

■紙の機能を活用したペーパーエレクトロニクスと紙センサー開発
■記録遺産としての書籍及び紙文化財の保存修復技術
■化学修飾木材を用いた高性能楽器用材の開発
■ナノスフェアを出発原料とした複合材料の調製
■含フッ素縮合系高分子を用いた複合材料の調製
■ポリアミノ酸や多糖類の化学修飾
■楽器用に用いられる生物材料の音響特性と物性制御
■木材のセル構造・FRP構造を活かした高度利用技術の開発
■天然接着剤（漆、キトサン等）の物性解明と利用技術の開発

■生物化学工学

■バイオシステム学コース
■遺伝資源産業科学
■遺伝子多様性学

■形質転換植物デザイン、遺伝子組換え植物の生物多様性影響評価、遺伝子組換え植物の食品安全性評価

■応用生命化学領域
■動物リソース工学

■核移植クローン技術を用いた生殖細胞ゲノムの特性解析
■核移植クローン技術を用いた胚性遺伝子活性化機序の解析
■顕微授精技術を用いた雄性生殖細胞保存技術の開発